sponge.colvar.AllAtoms

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class sponge.colvar.AllAtoms(system=None, num_atoms: int = None, keep_in_box: bool = False, dimension: int = 3, name: str = 'all_atoms')[源代码]

模拟系统的所有原子。

参数:
  • system (Molecule) - 模拟系统。默认值: None

  • num_atoms (int) - 原子的数量。当 system 为空时,必须给出原子的数量。默认值: None

  • keep_in_box (bool) - 是否在PBC框中替换坐标。默认值: False

  • dimension (int) - 仿真系统的空间维度。默认值:3。

  • name (str) - Colvar 的名称。默认值:'all_atoms'。

支持平台:

Ascend GPU