sponge.partition.IndexColvar

class sponge.partition.IndexColvar(use_pbc: bool = None)

基于索引的集体变量 (Collective variables)。

参数：

• use_pbc (bool，可选) - 是否在周期边界条件（PBC）下计算CV。如果给定 None ，则将在运行时基于是否给定 pbc_box 来确定。默认值： None。

支持平台：

Ascend GPU

set_pbc(use_pbc: bool)

设置周期边界条件。

参数：

• use_pbc (bool) - 是否在周期边界条件（PBC）下计算CV。如果给定 None，则将在运行时基于是否给定 pbc_box 来确定。

vector_in_pbc(vector: Tensor, pbc_box: Tensor)

将向量的差异设置在从-0.5 box 到0.5 box 的范围内。

参数：

• vector (Tensor) - shape为 \((B, A, D)\) 的Tensor。数据类型为float。系统的坐标。

• pbc_box (Tensor) - shape为 \((B, D)\) 的Tensor。数据类型为float。周期边界条件。