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规范和低错类

- 规范和低错类:

- 错别字或拼写错误,标点符号使用错误、公式错误或显示异常。

- 链接错误、空单元格、格式错误。

- 英文中包含中文字符。

- 界面和描述不一致,但不影响操作。

- 表述不通顺,但不影响理解。

- 版本号不匹配:如软件包名称、界面版本号。

易用性

- 易用性:

- 关键步骤错误或缺失,无法指导用户完成任务。

- 缺少主要功能描述、关键词解释、必要前提条件、注意事项等。

- 描述内容存在歧义指代不明、上下文矛盾。

- 逻辑不清晰,该分类、分项、分步骤的没有给出。

正确性

- 正确性:

- 技术原理、功能、支持平台、参数类型、异常报错等描述和软件实现不一致。

- 原理图、架构图等存在错误。

- 命令、命令参数等错误。

- 代码片段错误。

- 命令无法完成对应功能。

- 界面错误,无法指导操作。

- 代码样例运行报错、运行结果不符。

风险提示

- 风险提示:

- 对重要数据或系统存在风险的操作,缺少安全提示。

内容合规

- 内容合规:

- 违反法律法规,涉及政治、领土主权等敏感词。

- 内容侵权。

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sponge.partition.IndexColvar

查看源文件
class sponge.partition.IndexColvar(use_pbc: bool = None)[源代码]

基于索引的集体变量 (Collective variables)。

参数:
  • use_pbc (bool,可选) - 是否在周期边界条件(PBC)下计算CV。如果给定 None ,则将在运行时基于是否给定 pbc_box 来确定。默认值: None

支持平台:

Ascend GPU

set_pbc(use_pbc: bool)[源代码]

设置周期边界条件。

参数:
  • use_pbc (bool) - 是否在周期边界条件(PBC)下计算CV。如果给定 None,则将在运行时基于是否给定 pbc_box 来确定。

vector_in_pbc(vector: Tensor, pbc_box: Tensor)[源代码]

将向量的差异设置在从-0.5 box 到0.5 box 的范围内。

参数:
  • vector (Tensor) - shape为 (B,A,D) 的Tensor。数据类型为float。系统的坐标。

  • pbc_box (Tensor) - shape为 (B,D) 的Tensor。数据类型为float。周期边界条件。