mindsponge.common.get_fasta_info

mindsponge.common.get_fasta_info(pdb_path)[源代码]

给定一条蛋白质pdb文件(输入pdb文件路径),从pdb文件中获取序列信息并输出序列文本。

参数:
  • pdb_path (str) - 输入pdb文件的路径。

返回:
  • fasta_seq (str) 输出蛋白质pdb文件对应序列,该序列为pdb中氨基酸排列顺序和氨基酸编号无关。如”GSHMGVQ”。

支持平台:

Ascend GPU

样例:

>>> from mindsponge.common import get_fasta_info
>>> pdb_path = "YOUR PDB PATH"
>>> fasta = get_fasta_info(pdb_path)
>>> print(fasta)
"GSHMGVQ"