分子设计

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分子设计是药物发现的重要组成部分。广阔的化学空间涵盖了所有可能的分子,目前有些虚拟筛选库已经包含超过数十亿个分子,但是这些库也只占化学空间的很小一部分。与虚拟筛选相比,分子设计从广阔的化学空间搜索生成新的分子,但是传统的实验探索如此大的空间需要花费大量的时间和资源。近年来由于机器学习和AI方法的进步,为分子设计提供了新的计算思路。

MindSpore SPONGE生物计算工具包提供一系列基于深度生成模型的分子设计工具,帮助研究者进行高效的分子生成研究。

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功能

模型

训练

推理

后端

蛋白质序列设计

ProteinMPNN

×

GPU/Ascend

蛋白质序列设计

ESM-IF1

×

GPU/Ascend

未来我们还将提供抗体序列设计,分子生成等工具,敬请期待。