HHBLITS_AA_TO_ID
使用hhblits约定将氨基酸映射到对应编号，对一些未明确定义的单字母符号映射为确定值，如B可以表示天冬氨酸也可表示为天冬酰胺，这里规定B与D编号相同， 表示天冬氨酸（ASP），而J，O与X编号相同，表示未知氨基酸，U与C编号相同表示半胱氨酸（CYS），Z与E编号相同表示谷氨酸（GLU），’-‘表示缺失氨基酸。 除B、J、O、U、Z外，其余字母按顺序编号，字母含义与 restype_1to3 中的含义对应。
key |
value |
|---|---|
A |
0 |
B |
2 |
C |
1 |
D |
2 |
E |
3 |
F |
4 |
G |
5 |
H |
6 |
I |
7 |
J |
20 |
K |
8 |
L |
9 |
M |
10 |
N |
11 |
O |
20 |
P |
12 |
Q |
13 |
R |
14 |
S |
15 |
T |
16 |
U |
1 |
V |
17 |
W |
18 |
X |
20 |
Y |
19 |
Z |
3 |
- |
21 |