Release Notes

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MindSPONGE 1.0.0rc2 Release Notes

RASP & FAAST

  • [STABLE] RASP & FAAST是昌平实验室高毅勤团队开发的蛋白质结构解析工具。RASP（Restraints Assisted Structure Predictor）模型能接受抽象或实验约束，使它能根据抽象或实验、稀疏或密集的约束生成结构，可用于多种应用，包括改进多结构域蛋白和msa较少的蛋白的结构预测。FAAST（iterative Folding Assisted peak ASsignmenT）方法通过结合RASP与传统核磁共振数据解析方法，实现了核磁共振数据全自动解析。

Bug Fixes

  • [I8G9N5] 修复SPONGE中的分子模拟样例tutorial_b01.py get_item报错问题。

  • [I78EJO] 修复mindsponge.cell.TriangleAttention问题（shape不一致）。

  • [I7QZVK] 修复MEGA-Protein支持序列长度与文档不一致的问题。