自定义算子(基于Custom表达)
概述
当开发网络遇到内置算子不足以满足需求时,你可以利用MindSpore的Python API中的Custom原语方便快捷地进行不同类型自定义算子的定义和使用。
传统的添加一个自定义算子的方式,需要完成算子原语注册、算子实现、算子信息注册三部分工作。
其中:
算子原语:定义了算子在网络中的前端接口原型,也是组成网络模型的基础单元,主要包括算子的名称、属性(可选)、输入输出名称、输出shape推理方法、输出数据类型推理方法等信息。
算子实现:在Python侧定义函数(Ascend自定义算子)或C++侧定义类(GPU和CPU自定义算子),描述算子内部计算逻辑的实现。
算子信息:描述自定义算子的基本信息,如算子名称、支持的输入输出数据类型、支持的输入输出数据格式和属性等。它是后端做算子选择和映射时的依据。
相比于传统自定义算子方式,基于Custom
原语自定义算子具有如下优势:
不同的自定义算子对应的算子原语都是
Custom
原语,无需对每个自定义算子定义一个相应的算子原语。上述提到的三部分工作可以在网络脚本中以统一的接口进行实现,并作为网络表达的一部分,不需要对MindSpore框架进行侵入式修改和重新编译。实现了不同方式自定义算子的接口和使用统一,方便网络开发者根据需要灵活选用不同的自定义方式。
新增支持hybrid等自定义算子方式,并且可以跨平台使用。
基本用法
基于Custom原语的自定义算子支持的算子开发方式包括:hybrid、tbe、aicpu、aot、pyfunc、julia、akg。
不同的算子开发方式差异如下:
算子开发方式 |
开发语言 |
编译方式 |
支持平台 |
推荐场景 |
---|---|---|---|---|
MindSpore HYBRID DSL |
JIT |
|
全平台通用开发和快速验证 |
|
TBE DSL |
JIT |
|
Ascend AICORE自定义算子场景 |
|
C/C++ |
AOT |
|
Ascend AICPU自定义算子场景 |
|
C/C++/CUDA |
AOT |
|
高性能手写、对接调用第三方算子库场景 |
|
Python |
JIT |
|
快速算法验证、需要与Python进行交互等场景 |
|
Julia |
JIT |
|
科学计算场景、需要使用Julia编程等场景 |
|
MindSpore AKG DSL |
JIT |
|
用于开发验证场景,不建议普通用户使用 |
DSL全称是Domain Specific Language。
AOT(Ahead Of Time)编译方式指的是,算子实现函数需提前被编译为动态链接库,然后在网络运行时由框架自动调用;JIT(Just In Time)编译方式则不需要提前编译算子实现函数,而是在网络编译或运行期间被框架直接调用。
不同平台的不同场景下的推荐开发方式如下:
Ascend: hybrid(通用场景),aicpu(不规则运算的高性能实现);
GPU: hybrid(通用场景),aot(基于CUDA的高性能实现);
CPU: hybrid(通用场景),aot(基于C++的高性能实现)。
不同的开发方式使用不同的开发语言实现算子计算逻辑,但是自定义算子的开发流程是一致的,包括算子实现、算子输出shape和数据类型推理和算子信息注册(可选)。网络开发者可以根据需要选用不同的自定义算子开发方式。下面分别介绍这几种自定义算子开发方式,每种开发方式均提供示例。
更多示例可参考MindSpore源码中tests/st/ops/graph_kernel/custom下的用例。
Hybrid类型的自定义算子开发
Hybrid类型的自定义算子是自定义算子的默认定义类型。通过使用Hybrid类型的自定义算子,用户可以用类Python的语法描述算子计算逻辑,且无需关注MindSpore框架对于算子定义的工程细节,让用户专注于算法本身。
Hybrid类型的自定义算子使用MindSpore Hybrid DSL描述算子内部计算逻辑的实现。用MindSpore Hybrid DSL定义的函数可以被AKG算子编译器解析进行JIT编译生成高效算子,在大规模模型的训练推理中使用。同时,用MindSpore Hybrid DSL定义的函数可以当做一个numpy
函数直接调用,方便用户调试的同时也可以灵活的切换到pyfunc 类型的自定义算子,做到一次开发,多个模式多个平台多个场景复用的自定义算子表达。
下面用例(test_custom_hybrid.py)介绍hybrid类型的自定义算子开发流程,其中自定义算子实现两个输入张量相加的功能。
值得注意的是,Hybrid类型的自定义算子采取源码变换的方式打通MindSpore的图编译器和算子编译器,用户可以直接使用MindSpore Hybrid DSL提供的关键词,例如下面的output_tensor
,而无需引入对应Python函数。更多MindSpore Hybrid DSL关键词的介绍,参见MindSpore Hybrid DSL关键词。
import numpy as np
from mindspore import ops
import mindspore as ms
from mindspore.ops import kernel
ms.set_context(device_target="GPU")
# 算子实现,Hybrid DSL
@kernel
def add(a, b):
c = output_tensor(a.shape, a.dtype)
for i0 in range(a.shape[0]):
for i1 in range(a.shape[1]):
c[i0, i1] = a[i0, i1] + b[i0, i1]
return c
if __name__ == "__main__":
# 定义hybrid类型的自定义算子(Custom的默认模式)
op = ops.Custom(add)
x0 = np.array([[0.0, 0.0], [1.0, 1.0]]).astype(np.float32)
x1 = np.array([[2.0, 2.0], [3.0, 3.0]]).astype(np.float32)
output = op(ms.Tensor(x0), ms.Tensor(x1))
print(output)
本例中,有如下几点需要说明:
Hybrid类型是Custom的默认类型。
Hybrid类型自定义算子的输入必须是一个带有
@kernel
的函数。Hybrid类型自定义算子定义时可以使用自带的自动shape/dtype推导函数,也可以手动输入shape/dtype推导函数。
执行用例:
python test_custom_hybrid.py
执行结果:
[[2. 2.]
[4. 4.]]
tbe类型的自定义算子开发
tbe类型的自定义算子使用TBE(Tensor Boost Engine)算子DSL,描述算子内部计算逻辑的实现。算子DSL开发可以参考TBE文档。
算子输出shape和数据类型推理可以通过定义Python函数实现,描述算子输出shape和数据类型的推导逻辑。
这种类型的自定义算子需要注册算子信息,算子信息生成方式请参考算子信息注册。
下面以test_custom_tbe.py为例介绍tbe类型的自定义算子开发流程,其中自定义算子实现两个输入张量相加的功能。
test_custom_tbe.py内容:
import numpy as np
import mindspore as ms
import mindspore.ops as ops
from mindspore.ops import DataType, CustomRegOp, custom_info_register
ms.set_context(device_target="Ascend")
# 算子实现,注册算子信息
@custom_info_register(CustomRegOp() \
.input(0, "a") \
.input(1, "b") \
.output(0, "output") \
.dtype_format(DataType.F16_Default, DataType.F16_Default, DataType.F16_Default) \
.dtype_format(DataType.F32_Default, DataType.F32_Default, DataType.F32_Default) \
.target("Ascend") \
.get_op_info())
def add(a, b, output, kernel_name="add"):
import te.lang.cce
from te import tvm
data0 = tvm.placeholder(a.get("shape"), name="data0", dtype=a.get("dtype").lower())
data1 = tvm.placeholder(b.get("shape"), name="data1", dtype=b.get("dtype").lower())
res = te.lang.cce.vadd(data0, data1)
with tvm.target.cce():
sch = te.lang.cce.auto_schedule(res)
config = {"print_ir": False, "name": kernel_name, "tensor_list": [data0, data1, res]}
te.lang.cce.cce_build_code(sch, config)
if __name__ == "__main__":
# 定义tbe类型的自定义算子
op = ops.Custom(add, out_shape=lambda x, _: x, out_dtype=lambda x, _: x, func_type="tbe")
x0 = np.array([[0.0, 0.0], [1.0, 1.0]]).astype(np.float32)
x1 = np.array([[2.0, 2.0], [3.0, 3.0]]).astype(np.float32)
output = op(ms.Tensor(x0), ms.Tensor(x1))
print(output)
本例中,有如下几点需要说明:
用Python lambda函数定义输出shape和数据类型推理函数,并分别传给
Custom
原语的out_shape
和out_dtype
参数。本例中lambda函数表明输出shape和数据类型和第一个输入张量的信息相同。通过
CustomRegOp
生成算子信息,并通过custom_info_register
装饰器注册算子信息。
执行用例:
python test_custom_tbe.py
执行结果:
[[2. 2.]
[4. 4.]]
aicpu类型的自定义算子开发
aicpu类型的自定义算子采用AOT编译方式,要求算子开发者基于提供的特定接口,手写算子实现函数对应的源码文件,并提前将源码文件编译为动态链接库,然后框架会根据开发者在算子属性中配置的动态链接库名称,找到对应动态链接库并加载算子。具体算子实现参考CANN AICPU 自定义算子开发。
算子输出shape和数据类型推理可以通过定义Python函数实现,描述算子输出shape和数据类型的推导逻辑。
这种类型的自定义算子需要注册算子信息,算子信息生成方式请参考算子信息注册,aicpu类型的自定义算子,需要额外指定attr("cust_aicpu", "required", "str", "mindspore_aicpu_kernels")
的属性,用于MindSpore找到对应的算子实现的动态链接库。
需要注意的是,aicpu类型的自定义算子开发后编译成的动态链接库,需要存放到MindSpore的lib目录下,比如MindSpore安装在虚拟环境
/home/conda/envs/aicpu/lib/python3.7/site-packages/mindspore
下,则aicpu的so文件需要放到/home/conda/envs/aicpu/lib/python3.7/site-packages/mindspore/lib/
目录下。“cust_aicpu”的值为字符串,用算子动态链接库的名字去除
lib
前缀与.so
后缀表示,如libmindspore_aicpu_kernels.so
则设为"mindspore_aicpu_kernels"
即可。
下面以test_dropout_aicpu.py为例介绍aicpu类型的自定义算子开发流程,其中自定义算子实现了dropout的功能,并且编译好的算子动态链接库,我们命名为libmindspore_aicpu_kernels.so,并已将该动态链接库放至mindspore根目录的lib下。
test_dropout_aicpu.py内容:
import numpy as np
import mindspore as ms
import mindspore.nn as nn
import mindspore.ops as ops
from mindspore.ops import CustomRegOp, DataType
ms.set_context(mode=ms.GRAPH_MODE, device_target="Ascend")
# 算子实现,注册算子信息
dropout2d_op_info = CustomRegOp("Dropout2D") \
.fusion_type("OPAQUE") \
.input(0, "x", "required") \
.output(0, "y", "required") \
.output(1, "mask", "required") \
.attr("keep_prob", "required", "float") \
.attr("cust_aicpu", "required", "str", "mindspore_aicpu_kernels") \
.dtype_format(DataType.BOOL_Default, DataType.BOOL_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.I8_Default, DataType.I8_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.I16_Default, DataType.I16_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.I32_Default, DataType.I32_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.I64_Default, DataType.I64_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.U8_Default, DataType.U8_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.U16_Default, DataType.U16_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.U32_Default, DataType.U32_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.U64_Default, DataType.U64_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.F16_Default, DataType.F16_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.F32_Default, DataType.F32_Default, DataType.BOOL_Default) \
.dtype_format(DataType.F64_Default, DataType.F64_Default, DataType.BOOL_Default) \
.target("Ascend") \
.get_op_info()
# 定义自定义算子网络
class NetDropout2D(nn.Cell):
def __init__(self, keep_prob=0.5):
super(NetDropout2D, self).__init__()
self.op = ops.Custom("dropout2d_aicpu", out_shape=lambda x, _, cust_attr: (x, x), \
out_dtype=lambda x, _, cust_attr: (x, ms.bool_), func_type="aicpu",
reg_info=dropout2d_op_info)
self.keep_prob = keep_prob
self.cust_aicpu_so_path = "mindspore_aicpu_kernels"
def construct(self, inputs):
return self.op(inputs, self.keep_prob, self.cust_aicpu_so_path)
if __name__ == "__main__":
# 定义aicpu类型的自定义算子
input_tensor = ms.Tensor(np.ones([1, 1, 2, 3]), ms.float32)
dropout2d_nn = NetDropout2D(0.5)
output, mask = dropout2d_nn(input_tensor)
print("output: ", output)
print("mask: ", mask)
本例中,有如下几点需要说明:
可以用多种方式指定
Custom
原语的out_shape
和out_dtype
参数,可以给定类型,也可以用Python lambda函数等设置。本例中lambda函数表明输出的两个shape与输入相同,第一个输出的数据类型和输入张量的信息相同,第二个输出的数据类型为bool类型。通过
CustomRegOp
生成算子信息,并通过Custom
的reg_info
接口传入。
执行用例:
python test_dropout_aicpu.py
执行结果(由于dropout算子具有随机性,多次运行结果存在差异):
output : [[[[2. 2. 2.] [2. 2. 2.]]]]
mask: [[[[True True True] [True True True]]]]
aot类型的自定义算子开发
aot类型的自定义算子采用AOT编译方式,要求网络开发者基于特定接口,手写算子实现函数对应的源码文件,并提前将源码文件编译为动态链接库,然后在网络运行时框架会自动调用执行动态链接库中的函数。在算子实现的开发语言方面,GPU平台支持CUDA,CPU平台支持C和C++。源码文件中的算子实现函数的接口规范如下:
extern "C" int func_name(int nparam, void **params, int *ndims, int64_t **shapes, const char **dtypes, void *stream, void *extra);
其中,函数名func_name
可替换成任意有效函数名。返回值为int类型,约定0表示正常退出,非0表示发生异常。参数列表的含义如下:
nparam (int): 输入输出总数。比如算子有2个输入,1个输出,则nparam的值为3。
params (void **): 输入输出指针数组。比如算子有2个输入,1个输出,params[0]指向第一个输入数据,params[1]指向第二个输入数据,params[2]指向输出数据。
ndims (int *): 输入输出shape维度数组。比如params[i]是个shape[1024, 1024]的张量,则ndims[i]的值为2。
shapes (int64_t **): 输入输出shape数组。比如params[i]是个shape[1024, 1024]的张量,则shapes[i][0]的值为1024,shapes[i][1]的值为1024。
dtypes (const char **): 输入输出数据类型数组。dtypes里的元素取值可为:”float32”, “float16”, “float”, “float64”, “int”, “int8”, “int16”, “int32”, “int64”, “uint”, “uint8”, “uint16”, “uint32”, “uint64”, “bool”。
stream (void *): CUDA流指针,仅定义GPU算子实现时需要。
extra (void *): 用于后续扩展。
算子输出shape和数据类型推理可以通过定义Python函数实现,描述算子输出shape和数据类型的推导逻辑。
若自定义算子只支持特定的输入输出数据类型,则需要定义算子信息,算子信息生成方式请参考算子信息注册。
下面通过例子介绍GPU平台和CPU平台上aot类型的自定义算子开发流程,其中自定义算子实现两个输入张量相加的功能。
GPU示例
使用CUDA语言,编写算子实现的源码文件add.cu:
#define THREADS 1024
__global__ void CustomAddKernel(float *input1, float *input2, float *output, size_t size) {
auto idx = blockIdx.x * THREADS + threadIdx.x;
if (idx < size) {
output[idx] = input1[idx] + input2[idx];
}
}
extern "C" int CustomAdd(int nparam, void **params, int *ndims, int64_t **shapes, const char **dtypes, void *stream,
void *extra) {
cudaStream_t custream = static_cast<cudaStream_t>(stream);
if (nparam != 3) return 1;
void *input1 = params[0];
void *input2 = params[1];
void *output = params[2];
size_t size = 1;
for (int i = 0; i < ndims[2]; i++) {
size *= shapes[2][i];
}
int n = size / THREADS;
for (int i = 0; i < nparam; i++) {
if (strcmp(dtypes[i], "float32") != 0) {
return 2;
}
}
CustomAddKernel<<<n + 1, THREADS, 0, custream>>>(static_cast<float *>(input1), static_cast<float *>(input2),
static_cast<float *>(output), size);
return 0;
}
将add.cu编译成动态库add.so:
nvcc --shared -Xcompiler -fPIC -o add.so add.cu
编写测试用例test_custom_aot.py:
import numpy as np
import mindspore as ms
import mindspore.ops as ops
ms.set_context(device_target="GPU")
if __name__ == "__main__":
# 定义aot类型的自定义算子
op = ops.Custom("./add.so:CustomAdd", out_shape=lambda x, _: x, out_dtype=lambda x, _: x, func_type="aot")
x0 = np.array([[0.0, 0.0], [1.0, 1.0]]).astype(np.float32)
x1 = np.array([[2.0, 2.0], [3.0, 3.0]]).astype(np.float32)
output = op(ms.Tensor(x0), ms.Tensor(x1))
print(output)
本例中,有如下几点需要说明:
本例中需要将test_custom_aot.py和add.so放置在同一目录下,若add.so在其他目录,则需要将
Custom
第一个参数里路径修改为add.so的绝对路径。用Python lambda函数定义输出shape和数据类型推理函数,并分别传给
Custom
原语的out_shape
和out_dtype
参数。本例中lambda函数表明输出shape和数据类型和第一个输入张量的信息相同。未注册算子信息,所以自定义算子的算子信息将会从算子输入中推理。
执行用例:
python test_custom_aot.py
执行结果:
[[2. 2.]
[4. 4.]]
CPU示例
使用C或者C++语言,编写算子实现的源码文件add.cc:
#include <string.h>
using size_t = decltype(sizeof(int));
using int64_t = decltype(sizeof(long));
extern "C" int CustomAdd(int nparam, void **params, int *ndims, int64_t **shapes, const char **dtypes, void *stream, void *extra) {
if (nparam != 3) return 1;
float *input1 = static_cast<float *>(params[0]);
float *input2 = static_cast<float *>(params[1]);
float *output = static_cast<float *>(params[2]);
size_t size = 1;
for (int i = 0; i < nparam; i++) {
size *= shapes[2][i];
}
for (int i = 0; i < nparam; i++) {
if (strcmp(dtypes[i], "float32") != 0) {
return 2;
}
}
for (int i = 0; i < size; i++) {
output[i] = input1[i] + input2[i];
}
return 0;
}
将add.cc编译成动态库add.so:
g++ --shared -fPIC -o add.so add.cc
编写测试用例test_custom_aot.py:
import numpy as np
import mindspore as ms
import mindspore.ops as ops
ms.set_context(device_target="CPU")
if __name__ == "__main__":
# 定义aot类型的自定义算子
op = ops.Custom("./add.so:CustomAdd", out_shape=lambda x, _: x, out_dtype=lambda x, _: x, func_type="aot")
x0 = np.array([[0.0, 0.0], [1.0, 1.0]]).astype(np.float32)
x1 = np.array([[2.0, 2.0], [3.0, 3.0]]).astype(np.float32)
output = op(ms.Tensor(x0), ms.Tensor(x1))
print(output)
本例中,有如下几点需要说明:
本例中需要将test_custom_aot.py和add.so放置在同一目录下,若add.so在其他目录,则需要将
Custom
第一个参数里路径修改为add.so的绝对路径。用Python lambda函数定义输出shape和数据类型推理函数,并分别传给
Custom
原语的out_shape
和out_dtype
参数。本例中lambda函数表明输出shape和数据类型和第一个输入张量的信息相同。未注册算子信息,所以自定义算子的算子信息将会从算子输入中推理。
执行用例:
python test_custom_aot.py
执行结果:
[[2. 2.]
[4. 4.]]
pyfunc类型的自定义算子开发
pyfunc类型的自定义算子使用原生Python语法定义算子实现函数,描述算子内部计算逻辑的实现。网络运行时框架会自动调用此函数。
算子输出shape和数据类型推理可以通过定义Python函数实现,描述算子输出shape和数据类型的推导逻辑。
若自定义算子只支持特定的输入输出数据类型,则需要定义算子信息,算子信息生成方式请参考算子信息注册。
下面以test_custom_pyfunc.py为例介绍pyfunc类型的自定义算子开发流程,其中自定义算子实现两个输入张量相加的功能。
test_custom_pyfunc.py内容:
import numpy as np
import mindspore as ms
import mindspore.ops as ops
ms.set_context(device_target="CPU")
def add(a, b):
return a + b
if __name__ == "__main__":
# 定义pyfunc类型的自定义算子
op = ops.Custom(add, out_shape=lambda x, _: x, out_dtype=lambda x, _: x, func_type="pyfunc")
x0 = np.array([[0.0, 0.0], [1.0, 1.0]]).astype(np.float32)
x1 = np.array([[2.0, 2.0], [3.0, 3.0]]).astype(np.float32)
output = op(ms.Tensor(x0), ms.Tensor(x1))
print(output)
本例中,有如下几点需要说明:
用Python lambda函数定义输出shape和数据类型推理函数,并分别传给
Custom
原语的out_shape
和out_dtype
参数。本例中lambda函数表明输出shape和数据类型和第一个输入张量的信息相同。未注册算子信息,所以自定义算子的算子信息将会从算子输入中推理。
执行用例:
python test_custom_pyfunc.py
执行结果:
[[2. 2.]
[4. 4.]]
julia类型的自定义算子开发
julia类型的自定义算子使用Julia语法定义算子实现函数,描述算子内部计算逻辑的实现。网络运行时框架会自动调用执行相应的Julia函数。
算子输出shape和数据类型推导可以通过定义Python函数实现,描述算子输出shape和数据类型的推导逻辑。
若自定义算子只支持特定的输入输出数据类型,则需要定义算子信息,算子信息生成方式请参考算子信息注册。
下面以两个输入张量相加为例,介绍julia类型的自定义算子开发流程:
首先,用户需要通过单独文件实现Julia函数,如(add.jl):
# add.jl
module Add
# inputs: x, y, output: z, output should use .= to inplace assign
function add(x, y, z)
z .= x + y
end
end
其次,在网络脚本中通过自定义算子方式引用上面所写的Julia函数,以test_custom_julia.py为例:
import numpy as np
import mindspore as ms
import mindspore.ops as ops
ms.set_context(device_target="CPU")
if __name__ == "__main__":
# 定义julia类型的自定义算子
op = ops.Custom("./add.jl:Add:add", out_shape=lambda x, _: x, out_dtype=lambda x, _: x, func_type="julia")
x0 = np.array([[0.0, 0.0], [1.0, 1.0]]).astype(np.float32)
x1 = np.array([[2.0, 2.0], [3.0, 3.0]]).astype(np.float32)
output = op(ms.Tensor(x0), ms.Tensor(x1))
print(output)
本例中,有如下几点需要说明:
用Python lambda函数定义输出shape和数据类型推理函数,并分别传给
Custom
原语的out_shape
和out_dtype
参数。本例中lambda函数表明输出shape和数据类型和第一个输入张量的信息相同。未注册算子信息,所以自定义算子的算子信息将会从算子输入中推理。
执行用例:
python test_custom_julia.py
执行结果:
[[2. 2.]
[4. 4.]]
注意事项:
用户需确保下载正确版本的Julia,即version>=1.6.0。
由于运行时调用的Julia C api是从
libjulia.so
中获取的,因此需要用户设置julia/lib
到LD_LIBRARY_PATH
,以julia-1.6.5为例:# download julia-1.6.5 wget https://julialang-s3.julialang.org/bin/linux/x64/1.6/julia-1.6.5-linux-x86_64.tar.gz # extract file tar xvf julia-1.6.5-linux-x86_64.tar.gz # if $JULIA_DIR not exist export LD_LIBRARY_PATH=$PWD/julia-1.6.5/lib:$LD_LIBRARY_PATH # else export LD_LIBRARY_PATH=$JULIA_DIR/lib:$LD_LIBRARY_PATH
Custom
第一个入参指定用户书写的Julia函数需按照file_name:module_name:func_name
格式指定,file_name
需包含文件路径,建议使用绝对路径。Julia代码文件需包含
module
,module
内包含function
,且module
/function
都以end
结束。Julia函数的输入输出顺序需与算子的输入输出顺序一致。
Julia函数的最终输出,即kernel output的赋值需要使用
.=
,否则结果无法写入内存。Julia代码支持Julia的常用语法,用户需自行保证语法正确,函数可正确执行。
用户想在Julia文件内使用Julia的第三方软件包,需自行下载对应软件以确保能正确调用,可以通过
import pkg; pkg.add("somepkg")
进行安装。julia array
在内存上是column major
排列的,而numpy array
是row major
排列的,如果Julia和numpy做比较,非elemwise计算需考虑内存排布。在Julia函数中,可以通过如下代码示例进行numpy array
和julia array
的相互转换:function change_input_to_row_major(x) return permutedims(reshape(x, reverse(size(x))), length(size(x)):-1:1) end function change_output_to_row_major(x) return reshape(permutedims(x, length(size(x)):-1:1), size(x)) end
以矩阵乘为例:
# julia array is column-major, numpy array is row-major # user should change julia or numpy's layout to keep same behavior #= EXAMPLE A[2,3] B[3,4] C[2,4] NUMPY: [[1, 2, 3] [[1, 2, 3, 4] [[38, 44, 50, 56] [4, 5, 6]] [5, 6, 7, 8] [83, 98, 113,128]] [9,10,11,12]] JULIA: change_input_to_row_major: 1.inputs read numpy data from memory: [[1, 3, 5] [[1, 4, 7,10] [2, 4, 6]] [2, 5, 8,11] [3, 6, 9,12]] 2.inputs after reshape(reverse(shape)): [[1, 4] [[1, 5, 9] [2, 5] [2, 6,10] [3, 6]] [3, 7,11] [4, 8,12]] 3.inputs after transpose/permutedims: [[1, 2, 3] [[1, 2, 3, 4] [[38, 44, 50, 56] [4, 5, 6]] [5, 6, 7, 8] [83, 98, 113,128]] [9,10,11,12]] change_output_to_row_major: 1.output after transpose/permutedims: [[38, 83] [44, 98] [50,113] [56,128] 2.output after reshape: [[38, 50, 83, 113] [44, 56, 98, 128]] 3.output read numpy data from memory: [[38, 44, 50, 56] [83, 98,113, 128]] =# function foo!(x, y, z) x = change_input_to_row_major(x) y = change_input_to_row_major(y) z .= gemm(x, y, z) z .= change_output_to_row_major(z) end
akg类型的自定义算子开发
akg类型的自定义算子使用MindSpore AKG算子DSL,描述算子内部计算逻辑的实现。MindSpore AKG是基于TVM(Tensor Virtual Machine)和Polyhedral技术的算子开发和编译框架,支持Hybrid、IR builder和TVM compute等多种类型的算子DSL。
算子输出shape和数据类型推理可以通过定义Python函数实现,描述算子输出shape和数据类型的推导逻辑。
若算子包含属性或者只支持特定的输入输出数据类型或数据格式,则需要注册算子信息,算子信息生成方式请参考算子信息注册。若未注册算子信息,在后端做算子选择和映射的时候,将会从当前算子的输入中推导算子信息。
下面以test_custom_akg.py为例介绍akg类型的自定义算子开发流程,其中自定义算子实现两个输入张量相加的功能。
test_custom_akg.py内容:
import numpy as np
import mindspore as ms
import mindspore.ops as ops
ms.set_context(device_target="GPU")
# 算子实现,Hybrid DSL
def add(a, b):
c = output_tensor(a.shape, a.dtype)
for i0 in range(a.shape[0]):
for i1 in range(a.shape[1]):
c[i0, i1] = a[i0, i1] + b[i0, i1]
return c
if __name__ == "__main__":
# 定义akg类型的自定义算子
op = ops.Custom(add, out_shape=lambda x, _: x, out_dtype=lambda x, _: x, func_type="akg")
x0 = np.array([[0.0, 0.0], [1.0, 1.0]]).astype(np.float32)
x1 = np.array([[2.0, 2.0], [3.0, 3.0]]).astype(np.float32)
output = op(ms.Tensor(x0), ms.Tensor(x1))
print(output)
本例中,有如下几点需要说明:
set_context(device_target="GPU")
表示算子运行在GPU平台,若要运行在Ascend平台,请编译Ascend版本的MindSpore,并将device_target的值设置为”Ascend”。用Python lambda函数定义输出shape和数据类型推理函数,并分别传给
Custom
原语的out_shape
和out_dtype
参数。本例中lambda函数表明输出shape和数据类型和第一个输入张量的信息相同。未注册算子信息,所以自定义算子的算子信息将会从算子输入中推理。
执行用例:
python test_custom_akg.py
执行结果:
[[2. 2.]
[4. 4.]]
开发用例
开发前,我们导入 MindSpore 的相关依赖。
import numpy as np
import mindspore as ms
from mindspore import ops
from mindspore.ops import kernel
from mindspore.nn import Cell
#############################################
# 这里选用你使用的平台类型:CPU, GPU 或者 Ascend #
#############################################
ms.set_context(mode=ms.GRAPH_MODE, device_target="GPU")
# 选用CPU使用下面一行
# ms.set_context(mode=ms.GRAPH_MODE, device_target="CPU")
# 选用Ascend使用下面一行
# ms.set_context(mode=ms.GRAPH_MODE, device_target="CPU")
用例一:基于pyfunc模式定义sin算子
首先,我们写一个基于numpy的计算正弦函数的Python原生函数。
def sin_by_numpy(x):
return np.sin(x)
然后我们要定义两个函数,一个是张量形状的推导函数(infer_shape),另一个是张量数据类型的推导函数(infer_dtype)。这里要注意:
张量形状的推导函数是输入张量的形状;
张量数据类型的推导函数是输入张量的数据类型。
def infer_shape(x):
# 1. 这里的输入x是算子输入张量的形状
# 2. sin函数是逐元素计算,输入的形状和输出的一样
return x
def infer_dtype(x):
# 1. 这里的输入x是算子输入张量的数据类型
# 2. sin函数输入的数据类型和输出的一样
return x
下面我们用上面的函数自定义一个算子,其输入包括
func:自定义算子的函数表达,这里我们用
sin_by_numpy
函数;out_shape: 输出形状的推导函数,这里我们用
infer_shape
函数;out_dtype: 输出数据类型的推导函数,这里我们用
infer_dtype
函数;func_type: 自定义算子类型,这里我们用
"pyfunc"
。
然后我们调用算子计算结果。
sin_by_numpy_op = ops.Custom(func = sin_by_numpy, # 这里填入自定义算子的函数表达
out_shape = infer_shape, # 这里填入输出形状的推导函数
out_dtype = infer_dtype, # 这里填入输出数据类型的推导函数
func_type = "pyfunc" # 这里填入自定义算子类型
)
input_tensor = ms.Tensor([0,1, 0.2, 0.3, 0.4], dtype=ms.float32)
result_cus = sin_by_numpy_op(input_tensor)
print(result_cus)
我们可以得到结果为,即上面输入对应的sin值。
[0. 0.84147096 0.19866933 0.29552022 0.38941833]
用例二:利用hybrid类型的自定义算子实现三维张量的加法函数
首先,我们写一个基于MindSpore Hybrid DSL书写一个计算三维张量相加的函数。
注意:
对于输出张量使用
output_tensor
,用法为:output_tensor(shape, dtype)
;所有的计算需要基于标量计算,如果是Tensor对象,那么需要写清楚所有index;
基本循环的写法和Python一样,循环维度的表达可以使用
range
。
@kernel
def tensor_add_3d(x, y):
result = output_tensor(x.shape, x.dtype)
# 1. 你需要一个三层循环
# 2. 第i层循环的上界可以用x.shape[i]获得
# 3. 你需要基于每个元素表达计算,例如加法为 x[i, j, k] + y[i, j, k]
for i in range(x.shape[0]):
for j in range(x.shape[1]):
for k in range(x.shape[2]):
result[i, j, k] = x[i, j, k] + y[i, j, k]
return result
下面我们用上面的函数自定义一个算子。
注意到基于kernel
的hybrid
函数时,我们可以使用自动的形状和数据类型推导。
因此我们只用给一个func
输入(func_type
的默认值为"hybrid"
)。
tensor_add_3d_op = ops.Custom(func = tensor_add_3d)
input_tensor_x = ms.Tensor(np.ones([2, 3, 4]).astype(np.float32))
input_tensor_y = ms.Tensor(np.ones([2, 3, 4]).astype(np.float32) * 2)
result_cus = tensor_add_3d_op(input_tensor_x, input_tensor_y)
print(result_cus)
同时我们可以使用pyfunc
模式验证上面定义的正确性。
这里我们不需要重新定义算子计算函数tensor_add_3d
,直接将func_type
改为"pyfunc"
即可。
注意pyfunc
模式时我们需要手写类型推导函数。
def infer_shape_py(x, y):
return x
def infer_dtype_py(x, y):
return x
tensor_add_3d_py_func = ops.Custom(func = tensor_add_3d,
out_shape = infer_shape_py,
out_dtype = infer_dtype_py,
func_type = "pyfunc")
result_pyfunc = tensor_add_3d_py_func(input_tensor_x, input_tensor_y)
print(result_pyfunc)
我们可以得到如下结果,即两个Tensor的和。
[[[3. 3. 3. 3.]
[3. 3. 3. 3.]
[3. 3. 3. 3.]]
[[3. 3. 3. 3.]
[3. 3. 3. 3.]
[3. 3. 3. 3.]]]