restype_atom37_to_rigid_group

21种氨基酸按照稀疏编码方式，每种氨基酸中所包含原子所属的刚体变换组。shape为 \((21, 37)\) 。

每个原子所属的刚体变换组从 rigid_group_atom_positions 中获取。

8种group为

• 0 - backbone-group 氨基酸 \(N-C\alpha-C-C\beta\) 原子之间的扭转角 backbone 对应主链刚体变换组，CA为坐标原点，C在x轴正向，N在X-Y平面。

• 1 - pre-omega-group 氨基酸 \(N_i-C\alpha_i-N_{i-1}-C\alpha_{i-1}\) 原子之间的扭转角 pre-omega 对应刚体变换组。

• 2 - phi-group 氨基酸 \(C_i-C\alpha_i-N_i-C_{i+1}\) 原子之间的扭转角 phi 对应刚体变换组。

• 3 - psi-group 氨基酸 \(N_{i-1}-C_i-C\alpha_i-N_i\) 原子之间的扭转角 psi 对应刚体变换组。

• 4 - chi1-group

• 5 - chi2-group

• 6 - chi3-group

• 7 - chi4-group

chi1,2,3,4-group 在 chi_angle_atoms 相应氨基酸的相应扭转角中，扭转角由四个原子[A,B,C,D]的坐标确定，中间两个原子B,C为旋转轴，在x轴上；第3个原子C为坐标原点，原子B在x负半轴；第1个原子A在xy平面，从而确定该坐标下第4个原子坐标。

from mindsponge.common import residue_constants
print(residue_constants.restype_atom37_to_rigid_group)