mindsponge.common.get_fasta_info
- mindsponge.common.get_fasta_info(pdb_path)[源代码]
给定一条蛋白质pdb文件(输入pdb文件路径),从pdb文件中获取序列信息并输出序列文本。
- 参数:
pdb_path (str) - 输入pdb文件的路径。
- 返回:
fasta_seq (str) 输出蛋白质pdb文件对应序列,该序列为pdb中氨基酸排列顺序和氨基酸编号无关。如
"GSHMGVQ"
。
- 支持平台:
Ascend
GPU
样例:
>>> from mindsponge.common import get_fasta_info >>> pdb_path = "YOUR PDB PATH" >>> fasta = get_fasta_info(pdb_path) >>> print(fasta) "GSHMGVQ"