MindSpore
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mindsponge.cell
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mindsponge.data_transform
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sponge.colvar
sponge.control
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sponge.optimizer
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sponge.metrics
sponge.partition
Constants
atom_order
atom_types
chi_angles_atoms
chi_angles_mask
chi_groups_for_atom
chi_pi_periodic
HHBLITS_AA_TO_ID
ID_TO_HHBLITS_AA
restype_order
restype_atoms
residue_atom_renaming_swaps
resnames
resname_to_idx
restypes
restypes_with_x
restypes_with_x_and_gap
restype_1to3
restype_3to1
restype_atom14_mask
restype_atom14_rigid_group_positions
restype_atom14_to_rigid_group
restype_atom37_mask
restype_atom37_rigid_group_positions
restype_atom37_to_rigid_group
restype_name_to_atom14_names
restype_order
restype_order_with_x
restype_rigid_group_default_frame
rigid_group_atom_positions
van_der_waals_radius
HHBLITS映射至氨基酸类型
氨基酸相关常量
氨基酸中相关原子常量
氨基酸相关键长键角经验常量
范德华原子半径
扭转角相关常量
氨基酸局部坐标系相关常量
RELEASE NOTES
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MindSpore
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Constants
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van_der_waals_radius
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van_der_waals_radius
C
原子、
N
原子、
O
原子、
S
原子的范德华半径。
key
value
C
1.7
N
1.55
O
1.52
S
1.8