sponge.potential.EnergyCell =============================== .. image:: https://mindspore-website.obs.cn-north-4.myhuaweicloud.com/website-images/r2.2/resource/_static/logo_source.svg :target: https://gitee.com/mindspore/mindscience/blob/r0.5/MindSPONGE/docs/api/api_python/potential/sponge.potential.EnergyCell.rst :alt: 查看源文件 .. py:class:: sponge.potential.EnergyCell(name: str = 'energy', length_unit: str = 'nm', energy_unit: str = 'kj/mol', use_pbc: bool = None, **kwargs) 能量项的基础类。 `EnergyCell` 通常被用作传统力场中单独的能量项的一个基类。力场参数通常有单位,因此作为能量项的 `EnergyCell` 的单位必须与力场参数的单位保持一致,而不是与全局单位相同。 .. note:: - **B** - 批处理大小,用于模拟的walkers数目。 参数: - **name** (str) - 能量的名称。默认值: ``"energy"`` 。 - **length_unit** (str) - 长度单位。如果是None的话,与全局长度单位保持一致。默认值: ``"nm"`` 。 - **energy_unit** (str) - 能量单位。如果是None的话,与全局能量单位保持一致。默认值: ``"kj/mol"`` 。 - **use_pbc** (bool) - 是否使用周期性边界条件。默认值: ``None``。 - **kwargs** (dict) - 其他参数字典。 返回: Tensor。能量,shape为 :math:`(B, 1)` ,数据类型为float。 .. py:method:: check_system(system: Molecule) :property: 检查系统是否需要计算这个能量形式。 参数: - **system** (Molecule) - 系统。 .. py:method:: convert_energy_from(unit: str) 将能量数值从外部单位换算到内部单位。 参数: - **unit** (str) - 能量的单位。 返回: float,从外部单位换算到内部单位的能量数值。 .. py:method:: convert_energy_to(unit: str) 将能量数值从内部单位换算到外部单位。 参数: - **unit** (str) - 能量的单位。 返回: float,从内部单位换算到外部单位的能量数值。 .. py:method:: energy_unit() :property: 能量单位。 返回: str,能量单位。 .. py:method:: length_unit() :property: 长度单位。 返回: str,长度单位。 .. py:method:: name() :property: 能量的名称。 返回: str,能量的名称。 .. py:method:: set_cutoff(cutoff: float, unit: str=None) 设置截断距离。 参数: - **cutoff** (float) - 截断距离。 - **unit** (str) - 长度单位。默认值:``None``。 .. py:method:: set_input_unit(length_unit: Union[str, Units, Length]) 设置输入坐标的长度单位。 参数: - **length_unit** (Union[str, Units, Length]) - 输入坐标的长度单位。 .. py:method:: set_pbc(use_pbc: bool) 设置是否使用周期性边界条件。 参数: - **use_pbc** (bool) - 是否使用周期性边界条件。 .. py:method:: set_units(length_unit: str=None, energy_unit: str=None, units: Units=None) 设置长度、能量单位。 参数: - **length_unit** (str) - 长度单位。默认值: ``None`` 。 - **energy_unit** (str) - 能量单位。默认值: ``None`` 。 - **units** (Units) - 单位。默认值: ``None`` 。 .. py:method:: use_pbc() :property: 判断是否使用周期性边界条件。 返回: bool,返回一个标志来判断是否使用了周期性边界条件。