mindsponge.common.get_aligned_seq
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    :target: https://gitee.com/mindspore/mindscience/blob/r0.5/MindSPONGE/docs/api/api_python/common/mindsponge.common.get_aligned_seq.rst
    :alt: 查看源文件


.. py:function:: mindsponge.common.get_aligned_seq(gt_seq, pr_seq)

    输入两条蛋白质序列,对序列进行对齐,分别输出对齐后的序列以及两条序列的相同位置(顺序无要求)。

    参数:
        - **gt_seq** (str) - 一条蛋白质序列,如 ``"ABAAABAA"``。
        - **pr_seq** (str) - 需要比对的另外一条序列,如 ``"AAABBBA"``。

    返回:
        - **aligned_gt_seq** (str) 一条蛋白质序列。
        - **aligned_info** (str) 两条序列的不同点。
        - **aligned_pr_seq** (str) 另一条蛋白质序列。